Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms