Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms