Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Ighv1-42A0A0A6YY38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Ighv1-42A0A0A6YY38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Ighv1-42A0A0A6YY38 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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