Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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