Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv21A0A0A6YX06 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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Trbv21A0A0A6YX06 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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