Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B020011L13RikA0A087WQI7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms