Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r12a-201ENSMUST00000070663 3403 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Pla2g4c-203ENSMUST00000108528 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 CT009518.1-201ENSMUST00000224886 1571 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AU021092-201ENSMUST00000050160 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Fgr-204ENSMUST00000171223 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm15328-204ENSMUST00000210330 1518 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Spag8-201ENSMUST00000084646 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Cdh5-201ENSMUST00000034339 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Lif-202ENSMUST00000066283 4026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tom1l1-203ENSMUST00000107868 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm8778-201ENSMUST00000127246 1107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Elf5-207ENSMUST00000171693 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm3839-201ENSMUST00000181173 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm44037-201ENSMUST00000204816 1891 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC153526.3-201ENSMUST00000220145 2183 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Hadha-205ENSMUST00000156859 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Trim39-201ENSMUST00000042717 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tsnaxip1-201ENSMUST00000034365 2210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm36949-201ENSMUST00000192487 2327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm44873-201ENSMUST00000208490 3428 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms