Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ighv5-6-201ENSMUST00000103446 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms