Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 9530020I12Rik-202ENSMUST00000218368 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4930473H19Rik-202ENSMUST00000222124 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6187-201ENSMUST00000040649 960 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Spag11a-201ENSMUST00000058955 436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rpl32-201ENSMUST00000081840 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11461-201ENSMUST00000119909 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm14984-201ENSMUST00000120343 1263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm5398-201ENSMUST00000121933 984 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11468-201ENSMUST00000152987 383 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm13997-201ENSMUST00000155641 336 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mymk-202ENSMUST00000163967 1210 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm30932-201ENSMUST00000191893 274 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ighv1-65-201ENSMUST00000198790 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm18485-201ENSMUST00000203788 1114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6072-201ENSMUST00000203989 496 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm44018-201ENSMUST00000204471 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm44862-201ENSMUST00000207981 1055 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rps11-204ENSMUST00000211725 493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm34322-201ENSMUST00000214224 719 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC153798.1-201ENSMUST00000219942 244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC166358.1-201ENSMUST00000220677 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC153662.2-201ENSMUST00000221097 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC156037.2-201ENSMUST00000221284 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC166341.6-201ENSMUST00000221528 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 CT030242.1-201ENSMUST00000221945 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC124772.2-201ENSMUST00000222049 154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC153663.1-201ENSMUST00000222165 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 CT030157.1-201ENSMUST00000222355 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC150661.2-201ENSMUST00000222418 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC127242.2-201ENSMUST00000223138 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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