Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Olfr1418-201ENSMUST00000079875 1072 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm11199-201ENSMUST00000118691 507 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm22282-201ENSMUST00000158524 312 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm8964-201ENSMUST00000165944 805 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm8257-203ENSMUST00000179215 489 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm30932-201ENSMUST00000191893 274 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm42495-201ENSMUST00000200324 405 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm39132-201ENSMUST00000210446 429 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Tonsl-201ENSMUST00000078803 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Smim18J3QNP2 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms