Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Runx1-207ENSMUST00000189679 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ano4-208ENSMUST00000182613 3880 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Adgrf4-203ENSMUST00000167993 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Sec23a-204ENSMUST00000165134 2529 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm28187-201ENSMUST00000186885 2134 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gsk3b-202ENSMUST00000114750 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Anxa10-201ENSMUST00000034052 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Stam-201ENSMUST00000028050 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm44627-201ENSMUST00000206739 1531 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Olfr117-202ENSMUST00000213638 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gatb-204ENSMUST00000127348 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gsdmc2-203ENSMUST00000188691 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Pikfyve-202ENSMUST00000097707 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm16212-201ENSMUST00000136190 282 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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