Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 1700007E05Rik-202ENSMUST00000190494 1499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5394-201ENSMUST00000121935 975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cd209a-203ENSMUST00000207979 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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