Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Trpd52l3-201ENSMUST00000025727 2231 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Znrf3Q5SSZ7 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm13673-201ENSMUST00000122056 531 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo9-201ENSMUST00000001402 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm42759-201ENSMUST00000195915 2439 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms