Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 C8a-201ENSMUST00000048947 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 G3bp2-201ENSMUST00000113127 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Hbp1-202ENSMUST00000172314 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Adh6a-201ENSMUST00000013455 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 5430427N15Rik-201ENSMUST00000200007 2393 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tnpo3-202ENSMUST00000115251 3989 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26890-201ENSMUST00000180681 3221 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Spata31d1b-201ENSMUST00000165133 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Acsbg2-201ENSMUST00000043062 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tmem229b-204ENSMUST00000174072 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Cpa4-201ENSMUST00000049251 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Dgcr2-202ENSMUST00000066127 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Il1rl2-201ENSMUST00000095020 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1090-203ENSMUST00000217043 2054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tsnaxip1-201ENSMUST00000034365 2210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1506-201ENSMUST00000213994 2495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm45718-201ENSMUST00000207577 3794 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ly6c2-201ENSMUST00000100542 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930570D08Rik-201ENSMUST00000130431 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mrgprb11-ps-201ENSMUST00000187816 994 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Arhgef15-201ENSMUST00000065040 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm38012-201ENSMUST00000193022 3029 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 A730032A03Rik-202ENSMUST00000143202 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Rps6ka1-205ENSMUST00000157067 2637 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC122397.1-201ENSMUST00000228650 2819 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm26703-202ENSMUST00000181506 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ddx1-201ENSMUST00000071103 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Reg3a-201ENSMUST00000101272 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Esr2-203ENSMUST00000110421 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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