Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NefhP19246 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm13633-201ENSMUST00000120668 898 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NefhP19246 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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NefhP19246 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NefhP19246 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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