Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Brd8-204ENSMUST00000115766 4258 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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