Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hdac7Q8C2B3 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms