Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ugt1a6b-202ENSMUST00000113138 2303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Timeless-206ENSMUST00000105245 4402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC164625.1-201ENSMUST00000214034 3036 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ctse-202ENSMUST00000112411 1837 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Slc15a5-206ENSMUST00000171804 2461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm11534-202ENSMUST00000129261 470 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Lhx6-202ENSMUST00000112961 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Hadha-205ENSMUST00000156859 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm28187-201ENSMUST00000186885 2134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Arpp21-221ENSMUST00000162065 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mns1-201ENSMUST00000034746 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Zscan21-205ENSMUST00000110961 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Nron-203ENSMUST00000156297 3340 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ndrg3-203ENSMUST00000109558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm28410-201ENSMUST00000188113 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms