Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Rcbtb2-218ENSMUST00000169479 3351 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Tmem19-209ENSMUST00000219890 2949 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 AA986860-201ENSMUST00000039323 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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