Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Ldb2-205ENSMUST00000199261 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Hcar1-201ENSMUST00000164267 3285 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 5031434C07Rik-201ENSMUST00000053559 2894 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm19144-201ENSMUST00000221921 1859 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 AC153364.1-201ENSMUST00000220081 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Hdlbp-201ENSMUST00000042498 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gabrb2-201ENSMUST00000007797 3989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Tmprss11d-201ENSMUST00000031175 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Lancl1-201ENSMUST00000027149 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Apba2P98084 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 AC140393.1-202ENSMUST00000228347 1818 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Spdl1-201ENSMUST00000093191 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Mefv-201ENSMUST00000023180 3126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Apba2P98084 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms