Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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