Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Tssk4-207ENSMUST00000228395 1273 ntAPPRIS P5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm5560-201ENSMUST00000086918 892 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Naalad2-204ENSMUST00000166825 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm28451-201ENSMUST00000189311 2560 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm26520-201ENSMUST00000180719 1423 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Mageb2-202ENSMUST00000201779 1551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 4930425K24Rik-201ENSMUST00000222054 2143 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15328-204ENSMUST00000210330 1518 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Klrb1c-203ENSMUST00000174404 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm14260-201ENSMUST00000125121 260 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm8143-201ENSMUST00000203654 1186 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC155269.1-201ENSMUST00000220843 769 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms