Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 D5Ertd579e-201ENSMUST00000031091 6677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Lpl-201ENSMUST00000015712 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm11548-201ENSMUST00000140203 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 F730016J06Rik-202ENSMUST00000128888 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Pi4kb-203ENSMUST00000125476 3400 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Pycard-201ENSMUST00000033056 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm26703-202ENSMUST00000181506 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms