Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm28922-201ENSMUST00000189785 308 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Baalc-201ENSMUST00000163313 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms