Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm12970-201ENSMUST00000134911 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm9169-201ENSMUST00000182930 536 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm46344-201ENSMUST00000220530 887 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm28451-201ENSMUST00000189311 2560 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tifab-201ENSMUST00000169652 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Asns-201ENSMUST00000031766 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cblb-206ENSMUST00000227879 3866 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tnf-202ENSMUST00000167924 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 L3mbtl3-202ENSMUST00000105519 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm15742-201ENSMUST00000123905 659 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm26942-201ENSMUST00000182854 797 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC159203.1-201ENSMUST00000222039 769 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm19085-201ENSMUST00000188924 2162 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ufm1-203ENSMUST00000146598 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms