Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 I830134H01Rik-202ENSMUST00000181592 2755 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NrepQ07475 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Ccdc146-201ENSMUST00000030552 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Ighv3-8-201ENSMUST00000103483 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gngt2-204ENSMUST00000107709 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Rhox4f-201ENSMUST00000115170 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm11209-201ENSMUST00000130206 431 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Wfdc11-202ENSMUST00000167694 249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm42903-201ENSMUST00000202607 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Gm22369-201ENSMUST00000102415 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NrepQ07475 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms