Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Hibch-202ENSMUST00000159352 1704 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm11149-202ENSMUST00000215070 1169 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms