Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm8605-201ENSMUST00000221619 1370 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm9120-201ENSMUST00000190835 994 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 CT030157.1-201ENSMUST00000222355 148 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC150661.2-201ENSMUST00000222418 105 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm11875-201ENSMUST00000118187 799 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm13633-201ENSMUST00000120668 898 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms