Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Limch1-203ENSMUST00000117601 3157 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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