Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Nup155Q99P88 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Nup155Q99P88 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nup155Q99P88 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms