Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cabyr-202ENSMUST00000115857 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm28480-201ENSMUST00000186383 453 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Gm29154-206ENSMUST00000213410 1180 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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