Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PrcdQ00LT2 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms