Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms