Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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