Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Eps15-202ENSMUST00000102729 5190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Eif4enif1-201ENSMUST00000020734 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Cinp-202ENSMUST00000220607 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Myhas-201ENSMUST00000137662 787 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 2210408F21Rik-205ENSMUST00000138606 482 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Gm24786-201ENSMUST00000157379 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Gm25837-201ENSMUST00000158919 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm17800-201ENSMUST00000182466 971 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 1700012B07Rik-201ENSMUST00000020941 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Gm14267-205ENSMUST00000226697 1299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf217D3YYI7 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Klf10-201ENSMUST00000074043 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 4933436H12Rik-203ENSMUST00000207818 1466 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ndrg3-203ENSMUST00000109558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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