Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Mboat2-202ENSMUST00000110942 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zfp873-204ENSMUST00000210325 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Bcas1-202ENSMUST00000068137 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm12002-202ENSMUST00000153794 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Slc4a11-201ENSMUST00000099362 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Dbndd2-203ENSMUST00000109349 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Ly6c2-201ENSMUST00000100542 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm6467-201ENSMUST00000171547 609 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm28875-201ENSMUST00000185486 1189 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zg16-202ENSMUST00000205424 682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm45788-201ENSMUST00000212210 584 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 AC120386.1-201ENSMUST00000213434 736 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zg16-201ENSMUST00000051122 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Sema4d-202ENSMUST00000110039 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Stra6-214ENSMUST00000170397 3077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Rasgrf1-203ENSMUST00000189545 4766 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Acpp-202ENSMUST00000112590 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 4933412E24Rik-201ENSMUST00000096421 1748 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Mlst8-201ENSMUST00000070888 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Usp28-201ENSMUST00000047349 4133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gpkow-201ENSMUST00000049896 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm28557-203ENSMUST00000186303 3886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm15927-203ENSMUST00000148641 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm4877-201ENSMUST00000104977 798 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apba1B2RUJ5 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms