Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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