Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ChfrQ810L3 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ChfrQ810L3 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms