Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Atp7b-202ENSMUST00000110738 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Rbm6-ps2-201ENSMUST00000186440 1534 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Mrps31-201ENSMUST00000033934 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Sema4d-202ENSMUST00000110039 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gja1-201ENSMUST00000068581 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm37091-201ENSMUST00000195455 2087 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Vmn2r53-201ENSMUST00000170412 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Asph-208ENSMUST00000108334 2685 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Ablim1-205ENSMUST00000111526 2164 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm44641-201ENSMUST00000152342 323 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Serpinc1-202ENSMUST00000191936 725 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm33115-202ENSMUST00000223487 703 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Ctnna3-203ENSMUST00000105441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm21129-201ENSMUST00000185932 2560 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm29258-201ENSMUST00000186842 2564 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Atp2c1-212ENSMUST00000176770 2781 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Afap1l2-202ENSMUST00000118800 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Acbd5-201ENSMUST00000028121 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm10683-201ENSMUST00000211556 1374 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm43413-201ENSMUST00000200411 1566 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Slc2a12-201ENSMUST00000042261 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 4933402N03Rik-201ENSMUST00000070980 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tshz2-201ENSMUST00000109157 5083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Dlx1as-203ENSMUST00000140271 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm14967-201ENSMUST00000153483 335 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Sbp-207ENSMUST00000183252 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm18821-201ENSMUST00000184135 709 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm36070-202ENSMUST00000200467 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms