Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Tmem135-201ENSMUST00000041968 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm6480-201ENSMUST00000121552 1886 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Nckap5-202ENSMUST00000094609 2965 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm20371-201ENSMUST00000203354 1756 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Lrit3-202ENSMUST00000185462 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Asb3-201ENSMUST00000020551 3228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm6851-201ENSMUST00000154478 395 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm15833-201ENSMUST00000161563 957 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm27406-201ENSMUST00000184881 182 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1373-201ENSMUST00000078264 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Olfr444-201ENSMUST00000095955 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gsdmc2-201ENSMUST00000089900 1981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Ptk2-209ENSMUST00000226988 4444 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Lrrc43Q3V0L5 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Garnl3-207ENSMUST00000137381 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Rpa1-202ENSMUST00000092907 5077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Rhox3e-202ENSMUST00000115198 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Rhox3a-201ENSMUST00000115203 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mfap5-203ENSMUST00000121656 579 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm15448-204ENSMUST00000153846 2145 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 4931429L15Rik-203ENSMUST00000172280 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm379-201ENSMUST00000178160 888 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms