Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms