Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms