Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm14994-201ENSMUST00000117482 1092 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15504-201ENSMUST00000119674 265 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 n-R5s23-201ENSMUST00000122523 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4930417H01Rik-201ENSMUST00000123403 1233 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm8778-201ENSMUST00000127246 1107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4931406B18Rik-202ENSMUST00000163474 726 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm25306-201ENSMUST00000175288 117 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rpl7a-ps7-201ENSMUST00000198361 776 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43145-201ENSMUST00000198963 628 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm44426-201ENSMUST00000204258 355 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7476-201ENSMUST00000220112 661 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm21056-202ENSMUST00000223122 423 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC154283.2-201ENSMUST00000228954 614 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tonsl-201ENSMUST00000078803 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tac1-201ENSMUST00000090679 980 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Psg19-203ENSMUST00000182853 1518 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43413-201ENSMUST00000200411 1566 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms