Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 D5Ertd579e-201ENSMUST00000031091 6677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Lrguk-201ENSMUST00000070189 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Trpv2-201ENSMUST00000018651 2909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Fshb-201ENSMUST00000028533 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC159203.1-201ENSMUST00000222039 769 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm20072-201ENSMUST00000202231 292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Usp9yF8VPU6 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm26782-201ENSMUST00000181482 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Usp9yF8VPU6 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Usp9yF8VPU6 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Panx3-201ENSMUST00000011262 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Nasp-202ENSMUST00000030457 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm16497-201ENSMUST00000222024 2842 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Dnajc5b-204ENSMUST00000165693 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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