Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Atg3Q9CPX6 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Atg3Q9CPX6 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Atg3Q9CPX6 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Atg3Q9CPX6 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Atg3Q9CPX6 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Atg3Q9CPX6 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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