Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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