Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Sox5-204ENSMUST00000111748 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 4930453O03Rik-201ENSMUST00000147594 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Scamp1-204ENSMUST00000153558 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ly6c2-201ENSMUST00000100542 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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