Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm43465-201ENSMUST00000200367 2802 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm27034-201ENSMUST00000182552 940 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccdc18Q640L5 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc18Q640L5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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