Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms