Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms